生物顯微鏡-形態學測量指標與方法
1．灰度（sreylevel＞：指圖像各種顏色的深淺程度。目前的圖像分析儀可將灰度分為256級，如免疫組織化學標本的生物顯微鏡顯微圖像上反應產物的染色深淺即可用灰度來表示，能將一張標本上不同染色深度區分成為256級，這是肉眼所不及的。因此，某些實驗的結果，如果用光學顯微鏡作一般的觀察，似乎實驗組與對照組無明顯差異，而用顯微圖像分析系統經統計學分析，則可反映出顯著性差異，這說明僅僅用顯微鏡觀察是不夠的。
由于免疫反應產物在細胞內不一定是均勻分布的，在同一個細胞中就可產生各種灰度，這種情況如何進行比較?有兩種方法可供選用：一種方法是測每個細胞的平均灰度，另一種方法是在反應產物不均勻的細胞中可用每一種灰度所占的百分率來表示。例如要觀察1000個細胞，在這些細胞中各種灰度所占的百分率可測出，并作出曲線，或用其他統計學方法處理，進行比較。
有些生物顯微鏡顯微圖像分析系統中帶有光密度計組件，光密度計能將掃描器視頻信號變換成對應數值，然后數值化，就能用光密度單位來校正。因此，光密度計把被測物的積分光密度作為主要輸出，所謂積分光密度即各個單獨探測的像素密度分布的總和。因為容易得到被測物的面積，也就很容易求出平均密度。光密度在組織化學反應的定量領域內極為有用。灰度是—•種相對值，而光密度是值。在文獻中光密度常用oD（opticaldensity）表示。
2．長度：形狀不規則的線形組織結構，一般方法很難計算出其長度，如組織中的毛細血管、神經纖維、細胞超微結構中的各種膜性結構等，以往常用排列稀疏或稠密等詞描述，顯微圖像分析系統則可測出各種圖像的周界線長度。
3．面積：無論是在光鏡或電鏡下觀察的標本，都要涉及有關標本中某些結構的面積問題。即使是極不規則的結構，用生物顯微鏡顯微圖像分析系統也能算出其面積。在一定的放大倍數下，可以測出每2P“中含多少像素，因此畫出待測結構的輪廓，在所勾畫的范圍內含多少像素是立即可顯示出來的，這樣，很快可算出面積的數值。
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